Slovaquie : troisième pays de l'UE touché par un foyer de fièvre aphteuse
En mars 2025, la Slovaquie est devenue le troisième pays de l'Union européenne touché par une épidémie de fièvre aphteuse. Le virus de sérotype O, apparenté à une souche pakistanaise, a entraîné des quarantaines, des abattages d'urgence de milliers d'animaux et des interdictions d'exportation.
Première apparition depuis un demi-siècle
Le 21 mars 2025, les autorités slovaques ont confirmé l'apparition de la fièvre aphteuse (FMD) dans des exploitations agricoles proches de la frontière hongroise, une première depuis 1973. La Slovaquie est ainsi devenue le troisième pays de l'Union européenne touché par cette maladie virale hautement contagieuse en 2025, après l'Allemagne (janvier 2025) et la Hongrie (7 mars 2025).
Un virus venu du Pakistan et un lien avec la Hongrie
Les analyses de laboratoire du Laboratoire mondial de référence pour la FMD (WRLFMD) ont confirmé que l'agent pathogène est un sérotype O dont la séquence génétique la plus proche provient du Pakistan (2017-2018). La souche slovaque est par ailleurs parfaitement identique à la souche hongroise, ce qui confirme un lien épidémiologique direct entre les deux foyers via des mouvements d'animaux communs. L'apparition en Allemagne en janvier 2025 était en revanche due à une souche différente, les deux cas ne sont donc pas liés.
Zones touchées et étendue de la quarantaine
Les premiers foyers sont apparus dans le sud-ouest de la Slovaquie : dans les villages de Medveďovo, Ňárada, Baka et Lúč na Ostrove, dans les districts de Dunajská Streda et Komárno. Un cinquième cas a été confirmé le 30 mars 2025 à Plavecký Štvrtok, près de Malacky, dans l'une des plus grandes exploitations bovines de Slovaquie, avec une production quotidienne d'environ 95 000 litres de lait. Dans cette seule exploitation, plus de 3 500 têtes de bétail ont dû être abattues. Un sixième foyer est apparu à environ 70 kilomètres des autres cas.
Le ministère slovaque de l'Agriculture a mis en place des mesures d'urgence exceptionnelles, notamment des zones de protection d'un rayon de 3 km et des zones de surveillance d'un rayon de 10 km. Les mouvements d'animaux d'élevage ont été strictement limités dans tout le sud-ouest de la Slovaquie. Toutes les exploitations détenant des animaux d'élevage étaient tenues de s'inscrire au registre central avant le 9 avril 2025.
Réaction de l'UE et restrictions commerciales
La Commission européenne a adopté des décisions d'exécution définissant la régionalisation au niveau de l'UE et une équipe d'urgence vétérinaire de l'UE a été envoyée en Slovaquie le 21 mars 2025. Au moins 16 pays dans le monde ont instauré des interdictions d'importation d'animaux d'élevage et de produits animaux non transformés provenant des zones touchées. La République tchèque a renforcé les contrôles à la frontière, le foyer près de Malacky se trouvant à moins de 50 kilomètres du territoire tchèque.
Impact sur le secteur agricole
La fièvre aphteuse est extrêmement dangereuse pour les bovins, les porcs, les moutons, les chèvres et les sangliers. Bien que la maladie ne soit pas transmissible à l'homme, ses conséquences économiques sont dévastatrices : pertes d'animaux, interdictions d'exportation et interruption des chaînes d'approvisionnement ont touché des dizaines d'agriculteurs slovaques. Le gouvernement a promis des compensations, les paiements aux petits éleveurs devant être effectués dans la semaine, mais les grandes entreprises ont dû attendre plus longtemps pour être indemnisées.
Épilogue : La Slovaquie à nouveau indemne
Grâce à des mesures vétérinaires énergiques, la Slovaquie a retrouvé le statut de pays indemne de fièvre aphteuse à compter du 31 octobre 2025, ouvrant ainsi la voie à la reprise des relations commerciales. L'épidémie de 2025 a toutefois montré que les menaces virales qui pèsent sur l'agriculture européenne sont bien réelles et nécessitent une coopération vétérinaire transfrontalière constante.